个体工商户纳税采用三种税收制度：查账征收;定期定额征收;核定征收。
核定征收
适用于会计账簿不健全的个体户，其所得额不需要通过收入减去各项支出来计算。
核定征收又分为两种：
1.定额征收：直接核定所得额
2.核定应税所得率征收：按预先核定的应税所得率计算所得额
查账征收
与核定征收相反，查账征收适用于账簿、凭证、财务核算制度比较健全，能够如实核算，反映生产经营成果，正确计算应纳税款的纳税人，所以其应纳税额由收入总额减去相应的成本计算出。
采用查账征收的个体户，一定要建立账本，要不然怎么“查账”。所以，通常此类个体户会请代账公司帮忙做账和报税。
定期定额征收
定期定额征收简称“定期定额”，亦称为“双定征收”，是先由纳税人自报生产经营情况和应纳税款，再由税务机关对纳税人核定一定时期的税款征收率或征收额，实行增值税或营业税和所得税一并征收的一种征收方式。
这种方式主要对一些营业额、所得额难以准确计算的小型纳税人适用。
个体工商户做账注意要点
一般来说，个体户大多需要建立账本，如客户需要发票，可以申请税务局进行代开。
个体户既不能少缴税，也逃不过工商、税务的检查。从注册环节开始，到记账、报税、年报、乃至申请商标，个体户和公司没有什么特别不同的。
按照《个体工商户建账管理暂行办法》，如果您的注册资金在10万元以下，每个月的营业额在1万左右，那确实不需要记账，如果收入稍微再高点就应当依法设置账本了。换个角度想，做生意都是要考虑长远发展的，你总不能营业额一直“保持”1万以下吧.
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